В структуру Санкт-Петербургской академии Следственного комитета входят:

• Ректор
• Президент
• Проректор — руководитель отдела учебно-методической работы
• Проректор – руководитель отдела общественно-политической и воспитательной работы
• Проректор (по административно-хозяйственной работе)
• Помощник ректора
• Помощник ректора (по правовым вопросам)
• Помощник проректора
• Ученый секретарь
• Старший инспектор (по защите государственной тайны и мобилизационной работе)

---

Факультеты:

• Факультет подготовки следователей
• Факультет подготовки криминалистов
• Факультет подготовки научно-педагогических кадров и организации научно-исследовательской работы
• Факультет повышения квалификации

---

Кафедры (факультет подготовки следователей):

Уголовного права и криминологии

Уголовного процесса

Государственно-правовых дисциплин

Гражданско-правовых дисциплин

Гуманитарных и социально-экономических дисциплин, русского и иностранных языков

Физической и специальной подготовки

---

Кафедры (факультет подготовки криминалистов):

Криминалистики

Судебно-экспертной и оперативно-розыскной деятельности

Кафедра информационных технологий и организации расследования киберпреступлений

---

Кафедры (факультет повышения квалификации)

Управления следственной деятельности (Высшие академические курсы)

---

Кафедры

Юридической психологии и педагогики

---

Лаборатории:

---

Отделы:

Отдел учебно-методической работы

Научно-исследовательский отдел

Отдел материально-технического обеспечения

Отдел общественно-политической и воспитательной работы

Редакционно-издательский и информационно-библиотечный отдел

Финансово-экономический отдел

---

Отделения:

Отделение кадров

Отделение документационного обеспечения

Отделение вещевого и технического обслуживания отдела материально-технического обеспечения

Отделение содержания и текущего ремонта зданий и сооружений отдела материально-технического обеспечения

Отделение обеспечения безопасности

---

Военный-учебный центр

---

Филиалы:

Ростовский филиал

Нижегородский филиал